可他身边的从驾都是关中卫士，这些士兵怀念家乡，见杨广久居江都不归便暗生愤懑，如今见他又命人修建宫殿准备移驾长居，于是便纷纷逃归。

这时，虎贲郎将元礼等人与直阁裴虔通共谋，利用卫士们思念家乡的怨恨情绪，推宇文述的儿子宇文化及为首，发动兵变。

大业十四年三月十一日，管领禁军的武贲郎将司马德戡乘机煽动禁军叛乱，他先与另一位武贲郎将拓跋礼及直阁裴虔通密谋，后又串谋屯卫将军宇文化及和宇文智及兄弟。

叛军一经发动，便一发不可收拾，迅速包围了杨广居住的江都宫城，至夜间司马德戡引骁果自玄武门入，裴虔通与元礼直入宫中搜捕，身在宫中的杨广听闻兵变，带着萧皇后和宫人慌忙换装，慌乱中逃入西阁而不得出。

不久便被杀入宫中的裴虔通、元礼、马文举等人搜出押至寝殿，杨广对他们说“我实负百姓；至于尔辈，荣禄兼极，何乃如是！今日之事，孰为首邪？”

然宇文化及命令封德彝宣布杨广罪状，杨广对封德彝说“卿乃士人，何为亦尔？”

封德彝闻言满脸羞愧，逐转身离开，而杨广爱子杨呆，才刚刚十二岁，跟在杨广身边，因大声哭号惹恼了裴虔通，于是裴虔通便一刀将他杀死。

而后宇文化及欲令杨广速死，哪知杨广却说“天子自有天子的死法，怎么能对天子动刀，取鸩酒来！”

然马文举等人皆不答应，谓行事匆忙不曾备有，逐让令狐行达按着杨广坐下，杨广便自己解下练巾交给令狐行达，令狐行达便使练巾将之绞死。

杨广死后，由萧皇后和宫人拆床板做了一个小棺材，偷偷地葬在江都宫的流珠堂下，后江都太守陈棱集众缟素，为杨广发丧，备仪卫，改葬于吴公台下，而当时被杀的王公大臣，都埋葬在杨广坟茔的两侧。

是役，随杨广巡幸江都的隋氏宗室、外戚在江都宫中者皆被杀，惟杨广侄秦王浩（秦孝王杨俊长子杨浩）因素与宇文智及交往密切，得不死，并被立为帝，后宇文化及自封为大丞相，智及为左仆射，率隋官兵十余万众西归关中。